El ataque se produjo a las 9.50 horas en la escuela primaria de Prečko. El agresor, un joven, fue detenido.
La ministra de Salud, Irena Hrstic, dijo que el atacante tenía más de 18 años, pero los medios informaron que tenía 19.
Los vídeos publicados por los medios croatas muestran a niños huyendo del edificio de la escuela y a un helicóptero médico aterrizando en el patio de la escuela.
El primer ministro Andrejs Plenkovics admitió al comienzo de la reunión de gobierno que estaba consternado por el ataque y que las autoridades todavía estaban trabajando para descubrir exactamente qué había sucedido.
Varios niños fueron trasladados a diferentes hospitales de Zagreb, añadió el primer ministro.
HRT TV informa que el atacante entró en la escuela, inmediatamente se dirigió a la primera clase que llegaba y atacó a los niños.
Los ataques a escuelas son raros en Croacia.
En mayo pasado, en la vecina Serbia, un adolescente abrió fuego en una escuela de la capital, Belgrado, matando a nueve estudiantes y a un guardia de seguridad escolar.